Köszönöm de időközben megoldódott a probléma. A server.cfg-ben a plugins sorban a nativecheckernek az utolsó helyen kell lennie
Tehát ehelyett:
plugins crashdetect mysql nativechecker sscanf streamer Whirlpool
Így kellett:
plugins crashdetect mysql sscanf streamer Whirlpool nativechecker